明珠湾小学位于明珠湾核心区域——灵山岛尖，总建筑面积约19161.3平方米，设置24个班级，2021年9月正式开学，按规模招收小学一年级。学校主体建设了教学楼、风雨操场、素质教学楼、报告厅、活动楼等教育设施，以及食堂和地下车库等功能区域，纳入湾区实验学校教育集团管理，致力于打造灵山岛尖水乡社区具有现代化教学设施的高标准学校。